Структура миссий придерживается классической схемы, а именно: выполнил задачу - побил босса -прошёл на следующий этап. Как и прежде, нашему подшефному придётся спасать несчастных мирных граждан, традиционно оказавшихся не в то время не в том месте, а на сладкое - укатывать во что-нибудь твёрдое крупных криминальных авторитетов. В числе возмутителей спокойствия сплошь старые знакомые, такие как Rhino, Mysterio, Vulture и Shocker, а в финале поджидает сам Доктор Октопус (он же Отто Октавиус), затеявший весь переполох.